重庆市将建22个湿地自然保护区及17个湿地公园，包括建立长江三峡国家级湿地保护区，治理污染，修复生态。

       经普查发现，全市共有374条河流。这些河流的流域面积都大于50平方公里，长度至少10公里。除了长江和嘉陵江之外，全市流域面积大于5000平方公里的河流有10条，河中都可行船，如流经潼南、铜梁、合川的涪江，流经綦江的綦河，从贵州流下来的乌江、垫江，长寿地区的龙溪河等。

       调查显示，我市河流绝大部分在重庆境内就流入长江，只有少部分外流。酉阳、秀山等地的梅江河、龙潭河等流入了洞庭湖水系，城口的任河流入了汉江水系。

       全市共有2767处水库或湖泊，比较大的有长寿湖和大洪湖，合川的双河水库、红旗水库，大足的上游水库、铜梁的青云水库等。加上水稻田、温泉等，我市湿地总面积达24万公顷，占全市总面积的3%左右。三峡工程全面建成后，我市有可能成为全球最大的人工湿地，分布上千个岛屿。唯一遗憾的是，我市没有沼泽地。