水环境治理是个系统工程，而不仅仅是具体水体的问题，“就水论水”会给治水理念和实施手段上产生障碍，达不到应有的治理效果。 

       崔广柏教授说，太湖流域是我国经济发达、人口稠密的地区之一，随着经济迅猛发展及人口不断增加，排放的污染物也在增多。近几年来，政府投入了大量的财力，设立了无数的研究项目，但是从总体形势来看，太湖的富营养化问题还没有得到彻底解决，原因是在太湖富营养化治理上还存在一些误区。  

       没有从根本上进行太湖富营养化产生机理的研究，投入效益不明显。太湖富营养化问题主要不是在湖体，而应拓展到流域面上进行产污机理的研究，找出产生太湖富营养化的根本原因，才能有效地控制富营养化。而近几年的研究重点并不在此，均在终结的湖体。 可以发现几乎全集中在太湖水体上，包括在湖中种草，沿岸进行生态工程建设，投放必要的鱼类等等。这给整个太湖富营养化问题的解决设立了一个误区，以为只要在水中做文章就可以解决太湖水的问题，其结果是适得其反，没有从根本上解决治理太湖富营养化的思路问题，不但理论研究成果得不到实施的支持，同时太湖水质也没有得到较大幅度的提升。  

       在治理太湖富营养化问题的过程中还没有充分调动地方的积极性。太湖流域是一个经济高速发展的地区。水环境的优劣会直接影响区域经济的发展，各级政府已充分认识到这一点，也愿意投入大量资金进行区域内的水环境治理。但是大家并不了解整个太湖富营养化治理的整体方案，因此产生各自为政的治理行为，对太湖治理的贡献达不到预想的效果。这就告诫我们，在太湖治理上不仅仅要发挥上级主管部门的主导作用，同时要充分调动各级政府，甚至是最基层组织的积极性。这样不仅在财力上可以减轻国家的负担，而且使治理得到基层的分担，增强了治理方案的可操作性。

    水是跨行政区域流动的，无论从治水还是治污来看，必须在全流域范围内进行区域协调，这是当今解决水问题的根本所在。崔广柏提出了对太湖富营养化进行治理的工作思路，要充分认识到太湖富营养化治理的多学科性和多部门特征，太湖富营养化问题不是一个学科、几个研究院、几所大学，也不是任何一个部门所能解决的问题，它是一个系统工程。国家在研究开发项目设置过程中必须充分发挥各个学科的科技力量，包括基层单位的科技力量，联合所有涉水部门，在大框架下有序地进行研究和实施。  

       加强太湖富营养化产生机理的研究，从根本上解决治理决策措施问题。必须加强太湖流域富营养化产生的机理研究，深入探讨和弄清污染物质是怎样在流域面上输移、稀释、降解的物理、化学和生物学过程，这些污染物质进入湖体后在湖体中又是经历怎样的水动力和水热力的物理、化学和生物学过程，及其对太湖富营养化起到了怎样的作用。从全太湖流域着手，弄清了这个过程，才能对其做出全面的污染控制，达到最终的治理目标。  

       树立流域控制和区域控制相结合的新理念，充分调动地方治水的积极性。以流域为单元进行水环境治理具有一定的科学和实施上的可行性，其实施效果也是明显的。但是在新时期实施流域治理中，如果缺乏与区域治水相结合的协调理念，也将会是治水思路上的突出障碍。  

       崔广柏认为，在新的历史时期，治水工作必须从更高层次、从治水理念上来研究水生态、水景观和水文化建设的问题。着力构建生态水利体系，挖掘传统水文化，培养现代水文化，是发展经济、改善人居环境和生活质量、建设人与自然和谐社会的根本。在此基础上进一步着手建立水安全保障体系，确保饮用水安全、防洪排涝安全和生态环境安全。