三是三峡库区汇集了岷江、沱江、嘉陵江、乌江、金沙江、赤水河六大支流的来水以及若干小支流的来水，目前各个支流沿江城镇的生活污水和垃圾基本未处理，沿岸堆放垃圾现象普遍，水污染问题日趋严重。

——岷江水污染呈加重趋势。岷江沿岸接纳成都、眉山、乐山三地市工业废水以及生活污水。岷江入长江干流水质为III类，主要污染因子为高锰酸盐指数，成都的南河、府河和沙河等水质受到严重污染。

——沱江水污染严重。沱江沿岸接纳成都、德阳、内江、自贡、资阳等地市工业废水以及生活污水。沱江干流水质监测表明，沱江干流水质均超过III类，主要污染因子为溶解氧、高锰酸盐指数、非离子氨和亚硝酸盐，污染严重的河流有绵远河、毗河、绛溪河、球溪河、小青龙河和威远河。

——嘉陵江水质尚可，泥沙含量较高。污染较重的干流江段有嘉陵江广安段（氨氮超标）、渠江广安段（氨氮超标）和涪江遂宁段（镉、铅等重金属超标），污染较重的支流有西充河、达川州河等,主要超标因子为高锰酸盐指数和石油类。嘉陵江泥沙含量较高，占宜昌水文站泥沙来量的26%。

——金沙江水质较好，泥沙含量较大。攀枝花江段、楚雄江段水质污染较重，超过III类，主要超标因子为氨氮、高锰酸盐指数和石油类。金沙江支流中，四川的安宁河、云南的漾弓江、龙川江、普渡河和横江工业企业比较集中，河段污染严重，主要超标因子为氟化物、挥发酚、石油类和氨氮。金沙江泥沙含量较高，占宜昌水文站泥沙来量的46.8%。

——乌江中上游及重庆段水质较差，其他江段水质较好。乌江中上游贵阳、安顺、六盘水等地市生活污水基本未经处理直接入江，造成中上游水质污染严重，50%的河段丧失了使用功能，主要超标因子为氨氮、石油类和铅。乌江入长江干流涪陵段水质为III类，主要污染因子为高锰酸盐指数、氨氮。

——赤水河茅台镇以上水质较好，其余河段水质较差。赤水河入长江断面鲢鱼溪河段的水质已经超过III类，主要超标污染因子为氨氮。