（4）技术创新形式的转变
科学技术的内涵不仅限于传统的工艺技术，为管理服务的技术，为运营服务的技术，为设施建设服务的技术都应在大的技术内涵之中。
要由注重单项技术创新转向注重系统技术集成，注重技术对环境目标实现的贡献率，不能简单以技术水平来评价科技成果。
对于复杂的水体污染问题，迫切需要开展系统完整的技术创新研究，建立水体污染控制技术系统，跳出单元技术的约束，形成水体污染控制系统方案。
（5）基础性平台建设需要进入研究重点
长期以来将新工艺的探索作为基础研究的重点，对工艺的研究较好地支撑了中国的环境工程建设水平的提高。环境保护是一门综合的科学，工程设施是基础之一，但环境目标的成败最终取决其环境管理的成效。从目前中国环境领域的科技结构来看，基础研究的重心需要由单纯的工艺技术的先进性探索，转变为平台的建立上。
如行业经济基础数据的缺乏使政府监管难以实施，造成投资浪费和运营成本失控；环境控制基础数据的缺乏使环境目标难以落实，使政府不能做出科学的管理目标判断，使国家指定的环境目标多次落空；人体毒理研究的薄弱，使水质标准制定缺乏依据。解决这些问题需要数据采集和分析管理方式的进步，需要基础研究的长期跟踪。
