上个世纪80年代兴起于欧美的流域综合治理理念，从长期而言，或许是中国根治现有流域管理体制弊端的必由之路。
在现阶段，流域性水问题，特别是水污染，正在成为制约中国发展的重要瓶颈之一。专家呼吁，采用流域综合管理加以解决已成为当务之急。
10月15日下午，在山东东营举行的第三届黄河国际论坛上，一个由世界自然资金会和澳大利亚国际发展署资助，并由中国科学院科技政策与管理科学所、水利部黄河水利委员会等机构的专家完成的《中国流域综合管理现状与战略研究》报告举行了首发式。
这份于今年4月正式启动的报告发出警告说，中国正面临水环境、水资源、水生态和水灾害等紧迫的流域性水问题。复合型水污染及其在流域内的转移、综合性水资源短缺与饮用水安全问题、水利水电等工程引发的生态破坏与经济损失、以及由水旱灾害和污染事件等构成的综合性流域涉水灾害等等，都已经成为中国必须面对的重大课题。
而更加雪上加霜的是，全球变暖的趋势加剧了上述问题，增加了未来的不确定性和风险。
然而，在业内人士看来，中国现行流域管理体制根本无力应对如此复杂的局面。
尽管中国已经颁布《水法》、《水污染防治法》、《水土保持法》、《防洪法》这四部与水有关的法律，但至今尚无真正的流域法；加上法律之间也存在不一致的地方，执法成本过高，对违法惩治的力度有不足，根本无法形成有效的强制性法律约束。
其次，各相关管理部门的职能定位不清，缺乏有效的跨部门、跨地区的协调机制与平台，更加弱化了本已薄弱的法律能够起到的实际效力。例如，尽管主要水污染物的减排是“十一五”期间必须实现的约束性目标，但减排指标的分解主要是根据行政区划，至今也并未落实到各个流域。
实际上，即使行政主管部门有着积极性，如果不对流域特点进行充分考虑的话，在解决跨行政区的综合性流域问题时，往往也起不到应有效果。
虽然就国际上而言，各种经济激励政策，如流域生态补偿政策，都相当普遍；但在中国，因为市场经济的不完善和流域问题的复杂性，在执行过程中常常也面临种种障碍而难以操作。
此外，流域管理长期以来缺少利益相关方参与的问题，也一直没有得到有效解决，尤其是公众参与程度更是薄弱。一些地方政府和企业为了经济效益，不惜上高耗水、高污染、高排放的项目，而作为弱势群体的普通公众，往往被排斥在决策过程之外，不仅利益得不到保障，甚至连知情权都被剥夺，更谈不上参与。
而中国科学院院士孙鸿烈则直言不讳地指出，流域需要兼顾各方利益，特别是弱势群体的利益，以实现公平地共享流域公共福利。
以长江和黄河流域为例，这种割裂化的脆弱体制带来的弊端，已经暴露得一览无余。
