“环境保护范围很宽，上管天下管地，但新的环保部仍会有其核心职能和边缘职能。”对于改制后环保部职能的具体划分，王玉庆分析，核心职能不管大小，都有边界，且都会跟其他部门有关联。在跟其他部门进行职责划分时，应尽可能地做到职、责、权明晰，各个部门对具体事务管理到什么程度，都应作出相应的规定。

 “与环保相关的职能中，能够整合的尽量整合到环保部。”潘碧灵表示，但部分职能是一些部门几十年形成的，对于这些没有整合进来的职能，应该发挥环保部门协调统筹牵头的作用。

 “部门间即使有清晰的职能分工，也要合作，不可能经过一次机构改革，一个部门就管理了所有相关的事情。”王玉庆强调，如讨论了多年的环境税，如果实施起来，肯定并非环保部一个部门的事，还需要以财政和税务部门为主，环保部门相协调。

 因此，王玉庆又表示，除了职能分工的明确外，各部之间的合作也应该加强，对于具体事务的解决，相关部门应给予积极配合。

 “国家应保证相关部门之间联动机制的形成。”潘碧灵说。

 “环保部成立后，一些涉及到地方环保部门工作的方案，还有待进一步的研究。”王玉庆表示。

对于一些地方环保部门与地方政府存在的矛盾，鉴于环保的特殊性，王玉庆并不认为改制后，环保部将会全面推行环境监测执法垂直管理。“如果垂直管理，责任都在国家，就只能发挥环保部门的积极性。”王玉庆认为这也不符合地方政府对环境质量负责的法律规定。

但是，王玉庆表示，市以下级别地区可以试行环境监测垂直管理，这样能够减少一些地方政府的执法干扰。

“当然，中国环境的保护在于地方政府对环境的重视程度，地方环保部的执法能力，国家对环境问题的执法及处罚力度，以及企业及全体公民环保责任感的加强。”环保部成立后，对于中国环境问题的展望，王玉庆表示不要估计过高。