该指南明确反映出在废水利用和相关公共卫生问题方面存在区域差别。例如，东南亚地区在水产业中利用废水和污水，给本区域带来了特有的危险，如食源性吸虫病的传播。这种寄生性吸虫生活史复杂，涉及作为中间宿主的水生蜗牛和鱼类；含有寄生虫卵的人类污水污染了水体。而东南亚农村地区常见的吃法
-- 食用源自污染池塘的生鱼或发酵鱼肉 --
使得这一感染循环得以完成。
食源性吸虫感染造成的疾病负担数量可观：估计全球有4,000万人面临危险。最近的研究显示，仅在中国，寄生虫传染病之一的支睾吸虫病的发病数在1995-2004年间就增至三倍；2004年约有1,500万中国人感染了华枝睾吸虫病。据认为，该病很大程度上源于将污水和灰水用于鱼塘。
《世界卫生组织关于在农业和水产养殖业中安全利用废水、污水和灰水的指南》反映了世界卫生组织水、卫生设施和健康项目所召集的一组科学家、监管人员和公共卫生专家的知识和经验。下一步是世界卫生组织各会员国的实施工作。为研究在应用中可能遇到的困难和机遇，世界卫生组织和加拿大国际发展研究中心很快将在北非和/或西非的三个国家开始合作研究。