排污许可证是国家对在生产经营过程中排放废气、废水、产生环境噪声污染和固体废物的行为实行许可证管理，以期加强对污染源的监督管理及控制。

在欧美发达国家，排污许可证是最重要的环境管理制度之一，是执法检查的重要依据。于20世纪70年代最早在瑞典得以应用。

我国排污许可的实施可以追溯到1985年，最初从上海的水污染物排放许可证上得到应用，30年来，浙江、江苏、内蒙古、四川等25个省份均不同程度的制定了相关法规，占比超八成。2004年，原国家环境保护总局(现环保部)便在唐山市、深圳市、沈阳市、杭州市、银川市、武汉市等六市开展排污许可证试点工作。一路走来，排污许可证制度在我国推行三十年，总计向约24万家企事业单位发放了排污许可证，成效是有的；但却存在"推而不广"的尴尬。 许可证的运行原理看起来似乎并不复杂，但难点就在于，按我们以往对企业的环保管理要求和不同环保职能部门的管理的"套路"，根本就做不到能把"所有"要求逻辑清晰、贯穿如一地"放进"同一个许可证里。 长久以来的这些环保要求，不仅是"分散"成多套数据形式，长着"多张皮"的，甚至还经常是互相"打架"的。环境统计、总量核查、环评批复、"三同时"、排放标准要求、清洁生产要求、排污收费……各自是一套，分别对口不同的业务司局处室。当然，环保局给企业发的那么多凭证中，也曾有个名称叫做"排污许可证"的，跟上述管理制度之间也没有必然联系，就是一张写明被分配的总量的凭据而已。 因为各自为政，缺乏有机衔接和统一，也就导致了多年来不断"盲人摸象"，行政效能却还不高的结果。经常是该管理的没有管到位，环境家底、污染源依然是一笔糊涂账;不该管的却管过了头，管成了管理者和企业双方的沉重负担。 总体来看，排污许可制还存在在环境管理制度中核心基础地位不明确，在推动企事业单位落实治污主体责任方面发挥的作用不突出，环保部门依证监管不到位，各地要求不统一的尴尬点。