（三）改革水价形成机制
水价长期偏低和征收不全，既助长了水的浪费，又使供水、水利经营等单位入不敷出，得不到良性发展。
水价的涵义历来存有争议，现在对水价的内涵研究有所深化，概括起来，水价包含三方面内容：一是资源水价，即取用水资源要缴纳水资源费，体现国家对水资源的权属管理；二是工程水价，包括供水成本、合理利润和税收；三是环境水价，包括已开征的排污费、超标排污费、居民生活污水处理费以及正在考虑开征的保护水资源及生态环境补偿费。
水价改革的效果是比较明显的。如2000年宁夏农业用水价格由每方水6厘提高到每方12厘，当年就少引黄河水9亿m3。
（四）加强科技创新，推进水利现代化进程
新时期的水利工作正在经历由传统水利向现代水利的深刻转变，需要依靠科技进步和体制创新，促进水利建设现代化。“十五”期间和21世纪初期重点是要建立流域和区域防洪、水资源管理调度中心和水土保持监测中心，实现防洪科学指挥调度与水资源优化和实时调度。
有关水资源的管理体制、运作机制改革的问题较多，也非常复杂，需要通过立法和制度建设予以解决。目前全国人大、国务院法制办正在组织修订《水法》，已征求了有关部门和地区的意见，水利部也正在组织力量对有关问题进行研究。相信通过《水法》的修订和一些制度的建立，体制问题和机制问题将会逐步得到理顺和解决。我国水资源开发利用和保护管理，将全面走向依法治水、科学治水的道路，将更好地适应社会主义市场经济发展的需要，实现水资源可持续利用，保障经济社会的可持续发展。