通过本项目实施，总体上实现我国水污染控制与治理关键技术及制约因素的实质性突破，建立和完善适合我国国情的水污染控制与治理工程技术体系与监管体系，完善决策与监管所需的基础数据系统，以大幅度提高政府及全社会应对水环境问题的决策、监管和服务能力，促进体制与机制的理顺、市场规则的健全，全面引导和促进行业整体水平和企业竞争力的提高，为我国水环境治理与改善提供强有力的支撑。
项目总经费250000万元，其中申请国拨资金100000万元，项目承担单位自筹150000万元。项目实施周期为5年，2006年～2010年按实施条件成熟情况，逐步展开，同时兼顾长远规划，实施逐年调整与滚动机制，保障项目实施的实效性和延续性。